Московский областной НИИ акушерства и гинекологии - это головное научно-исследовательское учреждение России, координирующее научную деятельность однопрофильных институтов и кафедр медицинских вузов Министерства здравоохранения Российской Федерации.

В структуре МОНИИАГ имеется три крупных клинических отдела и подразделения вспомогательной службы - всего 15 подразделений.

На базе научно-консультативного отделения НИИ работает Центр планирования семьи и репродукции, отделение диагностики, мониторинга и регистра врожденных пороков развития, лечебно-диагностический Центр "Сахарный диабет и беременность".

На базе клиник института работает кафедра акушерства и гинекологии ФУВ МОНИКИ им. М.Ф. Владимирского. В институте функционирует одна из ведущих в стране клиник гнойной хирургии в гинекологии.

МОНИИАГ это центр Московской области по лечению беременных с заболеваниями, передающимися половым путем (ЗППП).

Ежегодно в гинекологическую клинику МОНИИАГ поступает до 900 женщин из различных лечебных учреждений Московской области. За год в клинике проводится более 800 гинекологический операций и около 2000 родов.